Pada masa pandemi ini Global Islamic School menerapkan Protokol Kesehatan diantaranya melakukan seterilisasi dangan penyemprotan desinfektan, pengecekan suhu tubuh, mewajibkan mengenakan masker untuk setiap orang yang keluar masuk area sekolah, dan menyiapkan hand sanitizer/tempat cuci tangan sebelum memasuki area sekolah.